Especialistas em biodiversidade da Permian Brasil publicam artigos sobre análises e monitoramento de aves

Entre os especialistas em biodiversidade e conservação que fazem parte da Permian Brasil, José Fernando Pacheco e Albert Aguiar possuem grande experiência na área de ornitologia. Três trabalhos de pesquisa deles acabaram de ser publicados em renomadas revistas nacionais e internacionais. 

Os especialistas em biodiversidade da Permian Brasil trouxeram novos estudos para as publicações científicas do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo, ZooBank e também do periódico Bioacoustics. Foram analisados o histórico e parentesco entre espécies de aves, a partir de análises genéticas e informações subjacentes e também o monitoramento acústico. 

Os trabalhos em que José Fernando Pacheco participou foram importantes para resgatar informações históricas de uma ave mal conhecida, o tietê-de-coroa, e para traçar o parentesco mais refinado entre espécies assemelhadas. O tietê-de-coroa (Calyptura cristata) é considerado criticamente ameaçado ou já pode estar extinto, com poucos avistamentos no século XX não documentados. Pacheco e colegas levantaram o acervo museológico da espécie, apresentando os dados disponíveis nas etiquetas e livros de tombo e também discutindo as variações de plumagem encontradas nos 104 exemplares localizados, sobretudo na Europa. 

Já o artigo “Sistemática de Neopelminae (Aves: Passeriformes: Pipridae) com descrição de um novo gênero”, a partir da hipótese de que a espécie Neopelma aurifrons seria mais próxima de outras duas espécies amazônicas, sendo confirmado através de análise filogenéticas. Este estudo permitiu a compreensão das linhas genéticas dessas espécies e evolução e ajustes de taxonomia, de acordo com as características das aves estudadas. 

Albert participou do estudo intitulado “O som da esperança: busca por espécies criticamente ameaçadas usando correspondência de modelos acústicos”, onde três das espécies mais ameaçadas de aves serviram de base para a criação de modelos de busca de suas vozes por um fluxo para processamento das gravações acústicas autônomas. Por meio da captação dos sons, é possível identificar as espécies ali existentes, com base em extensos bancos de áudio, contribuindo para encontrar estas espécies, que estão próximas da extinção. Dessa forma, este é um trabalho impossível sem ajuda da automatização, afinal, são milhares de horas gravadas e que não precisam ser ouvidas para encontrar novas populações destas espécies. 

Leia na íntegra os estudos:​ 

A joia perdida da Mata Atlântica: Tietê-de-coroa Calyptura cristata (Aves: Platyrinchidae) inventário de exemplares e variação de plumagem 

Tietê-de-coroa Calyptura cristata é um dos grandes enigmas da avifauna sul-americana. Endêmica de uma área aparentemente pequena do sudeste do Brasil, no bioma Mata Atlântica, a espécie não foi vista definitivamente entre o segundo terço de 1800 e 1996, quando foi brevemente redescoberta na floresta submontana a noroeste do Rio de Janeiro. Janeiro. Desde então, C. cristata foi relatada diversas vezes, mas sem documentação e sempre por observadores únicos.

Atualmente é considerado Criticamente Ameaçado pela BirdLife International, e vários autores especularam que a espécie já pode estar extinta. Dada a extrema escassez de conhecimento desta espécie, fornecemos um inventário completo do material museológico de Tietê-de-coroa – estão listados mais de 100 exemplares, a maioria mantidos em colecções europeias, quase duplicando as estimativas anteriores feitas na literatura. Vários são mantidos em instituições relativamente pequenas, sugerindo assim que ainda mais espécimes poderão ser identificados ou encontrados. Além disso, com o benefício desta grande amostra de material, discutimos a variação morfológica nas espécies e levantamos hipóteses particularmente sobre o aparecimento de plumagens masculinas, femininas e juvenis. 

Sistemática de Neopelminae (Aves: Passeriformes: Pipridae) com descrição de um novo gênero 

A partir do exame de dados do repertório vocal e preferência de habitat, bem como da morfologia, Bret Whitney, Fernando Pacheco e Ricardo Parrini propuseram em 1995 que o gênero Neopelma, conforme definido atualmente, não é monofilético (com ancestral comum) e levantou a hipótese de que Neopelma aurifrons seria mais próximo das duas espécies amazônicas de Tyranneutes. João Capurucho e colegas (2018) investigaram as relações em Neopelma e Tyranneutes e descobriu que Neopelma era de fato parafilético. Sua análise filogenética indicou que Tyranneutes está aninhado em Neopelma, e que N. chrysolophum é irmão de um clado contendo Tyranneutes e o restante de Neopelma. 

Harvey e colaboradores (2020) incluíram todos os táxons em nível de espécie de Neopelma e Tyranneutes. Sua topologia era consistente com o de Capurucho e colegas (2018), resultando em Neopelma parafilético em relação à Tyranneutes. Apesar disso, eles descobriram que Neopelma aurifrons não é espécie-irmã de N. chrysolophum, mas representa a divergência mais antiga dentro do restante Neopelma após a separação de Tyranneutes. 

A resolução da parafilia requer, portanto, a colocação do Neopelma em dois gêneros distintos. Como aurifrons é a espécie-tipo de Neopelma, um novo nome de gênero é necessário para N. chrysolophum: Protopelma. 

O som da esperança: busca por espécies criticamente ameaçadas usando correspondência de modelos acústicos 

O Monitoramento Acústico Passivo (PAM) tornou-se cada vez mais popular no monitoramento da biodiversidade. Produz grandes quantidades de dados e pode fornecer uma base para a compreensão das consequências a longo prazo da degradação ambiental. No entanto, extrair informações biológicas de conjuntos de dados tão extensos pode ser desafiador e requer habilidades computacionais avançadas. Aqui, apresentamos um fluxo de trabalho simplificado para detecção de sinais acústicos de três aves criticamente ameaçadas: saíra-apunhalada(Nemosia rourei), choquinha-de-alagoas (Myrmotherula snowi) e rolinha-do-planalto (Columbina cyanopis). Como estas espécies estão entre as aves mais ameaçadas do mundo, a localização de novas populações é uma prioridade máxima.

Escolhemos modelos potenciais com base nos parâmetros acústicos do repertório vocal e avaliamos seu desempenho utilizando paisagens sonoras com composição conhecida (dados padrão ouro). Para avaliar a eficiência dos modelos, usamos métricas de precisão e recall e descobrimos que alcançar altas taxas de precisão tem o custo das taxas de recall. Embora tenhamos usado dados padrão-ouro para calibrar nosso algoritmo, validações em larga escala revelaram as limitações, pois alguns modelos exibiram valores de precisão significativamente mais baixos. O uso de modelos binomiais ajudou a redefinir os valores de precisão para 90%. Nosso fluxo de trabalho pode processar grandes quantidades de dados de forma eficiente, ajudando a monitorar populações dessas espécies criticamente ameaçadas, localizar novas populações e avaliar a dinâmica populacional.